Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TMEM258P61165 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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TMEM258P61165 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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TMEM258P61165 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TMEM258P61165 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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