Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms