Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCCD1P59942 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCCD1P59942 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms