Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms