Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BACE1P56817 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BACE1P56817 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BACE1P56817 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BACE1P56817 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BACE1P56817 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BACE1P56817 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BACE1P56817 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BACE1P56817 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BACE1P56817 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BACE1P56817 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BACE1P56817 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BACE1P56817 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BACE1P56817 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BACE1P56817 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BACE1P56817 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BACE1P56817 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BACE1P56817 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BACE1P56817 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BACE1P56817 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BACE1P56817 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BACE1P56817 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BACE1P56817 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BACE1P56817 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BACE1P56817 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BACE1P56817 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BACE1P56817 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BACE1P56817 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BACE1P56817 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BACE1P56817 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BACE1P56817 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BACE1P56817 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BACE1P56817 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BACE1P56817 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BACE1P56817 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BACE1P56817 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BACE1P56817 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BACE1P56817 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BACE1P56817 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BACE1P56817 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BACE1P56817 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BACE1P56817 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BACE1P56817 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BACE1P56817 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BACE1P56817 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BACE1P56817 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BACE1P56817 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BACE1P56817 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BACE1P56817 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BACE1P56817 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BACE1P56817 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BACE1P56817 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BACE1P56817 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BACE1P56817 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BACE1P56817 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BACE1P56817 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BACE1P56817 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BACE1P56817 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BACE1P56817 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BACE1P56817 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BACE1P56817 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BACE1P56817 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BACE1P56817 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BACE1P56817 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BACE1P56817 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BACE1P56817 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BACE1P56817 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BACE1P56817 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BACE1P56817 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BACE1P56817 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BACE1P56817 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BACE1P56817 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BACE1P56817 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BACE1P56817 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BACE1P56817 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BACE1P56817 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BACE1P56817 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BACE1P56817 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BACE1P56817 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BACE1P56817 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BACE1P56817 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BACE1P56817 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BACE1P56817 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BACE1P56817 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BACE1P56817 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BACE1P56817 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BACE1P56817 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BACE1P56817 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BACE1P56817 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BACE1P56817 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BACE1P56817 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BACE1P56817 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BACE1P56817 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BACE1P56817 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BACE1P56817 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BACE1P56817 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BACE1P56817 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BACE1P56817 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BACE1P56817 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BACE1P56817 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms