Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSWP56202 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSWP56202 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSWP56202 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSWP56202 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSWP56202 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSWP56202 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSWP56202 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSWP56202 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSWP56202 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSWP56202 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSWP56202 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSWP56202 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSWP56202 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSWP56202 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSWP56202 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSWP56202 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSWP56202 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSWP56202 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSWP56202 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSWP56202 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSWP56202 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSWP56202 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSWP56202 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSWP56202 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSWP56202 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSWP56202 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSWP56202 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSWP56202 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSWP56202 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSWP56202 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSWP56202 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSWP56202 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSWP56202 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSWP56202 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSWP56202 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSWP56202 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSWP56202 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSWP56202 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSWP56202 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSWP56202 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSWP56202 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSWP56202 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSWP56202 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSWP56202 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSWP56202 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSWP56202 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSWP56202 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSWP56202 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSWP56202 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSWP56202 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSWP56202 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSWP56202 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSWP56202 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSWP56202 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSWP56202 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSWP56202 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSWP56202 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSWP56202 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSWP56202 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSWP56202 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSWP56202 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSWP56202 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSWP56202 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSWP56202 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSWP56202 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSWP56202 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSWP56202 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSWP56202 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSWP56202 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSWP56202 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSWP56202 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSWP56202 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSWP56202 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSWP56202 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSWP56202 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSWP56202 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSWP56202 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSWP56202 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSWP56202 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSWP56202 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSWP56202 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSWP56202 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTSWP56202 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTSWP56202 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTSWP56202 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTSWP56202 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTSWP56202 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTSWP56202 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTSWP56202 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTSWP56202 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTSWP56202 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTSWP56202 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CTSWP56202 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CTSWP56202 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTSWP56202 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CTSWP56202 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CTSWP56202 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTSWP56202 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CTSWP56202 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms