Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFDNP55196 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFDNP55196 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFDNP55196 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFDNP55196 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFDNP55196 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AFDNP55196 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFDNP55196 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFDNP55196 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFDNP55196 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFDNP55196 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFDNP55196 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFDNP55196 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFDNP55196 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFDNP55196 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AFDNP55196 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFDNP55196 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFDNP55196 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFDNP55196 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFDNP55196 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFDNP55196 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFDNP55196 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AFDNP55196 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFDNP55196 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFDNP55196 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFDNP55196 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFDNP55196 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFDNP55196 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AFDNP55196 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFDNP55196 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFDNP55196 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFDNP55196 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFDNP55196 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFDNP55196 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AFDNP55196 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFDNP55196 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFDNP55196 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFDNP55196 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFDNP55196 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
AFDNP55196 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFDNP55196 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFDNP55196 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFDNP55196 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFDNP55196 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFDNP55196 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFDNP55196 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFDNP55196 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFDNP55196 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFDNP55196 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
AFDNP55196 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFDNP55196 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
AFDNP55196 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFDNP55196 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFDNP55196 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFDNP55196 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFDNP55196 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFDNP55196 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFDNP55196 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFDNP55196 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFDNP55196 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFDNP55196 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms