Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LUMP51884 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LUMP51884 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LUMP51884 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LUMP51884 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LUMP51884 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LUMP51884 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LUMP51884 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LUMP51884 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LUMP51884 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LUMP51884 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LUMP51884 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LUMP51884 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LUMP51884 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LUMP51884 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms