Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB28P51157 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB28P51157 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB28P51157 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB28P51157 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB28P51157 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB28P51157 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB28P51157 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB28P51157 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB28P51157 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB28P51157 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB28P51157 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB28P51157 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB28P51157 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB28P51157 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB28P51157 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB28P51157 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB28P51157 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB28P51157 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB28P51157 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB28P51157 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB28P51157 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB28P51157 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB28P51157 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB28P51157 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB28P51157 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB28P51157 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB28P51157 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB28P51157 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB28P51157 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB28P51157 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB28P51157 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB28P51157 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB28P51157 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB28P51157 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB28P51157 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB28P51157 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB28P51157 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB28P51157 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB28P51157 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB28P51157 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB28P51157 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB28P51157 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB28P51157 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB28P51157 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB28P51157 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB28P51157 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB28P51157 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB28P51157 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB28P51157 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB28P51157 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB28P51157 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB28P51157 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB28P51157 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB28P51157 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB28P51157 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB28P51157 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB28P51157 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB28P51157 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB28P51157 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB28P51157 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB28P51157 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB28P51157 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB28P51157 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB28P51157 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB28P51157 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms