Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms