Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIP4K2AP48426 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PIP4K2AP48426 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIP4K2AP48426 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIP4K2AP48426 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIP4K2AP48426 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIP4K2AP48426 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PIP4K2AP48426 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIP4K2AP48426 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIP4K2AP48426 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIP4K2AP48426 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIP4K2AP48426 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIP4K2AP48426 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIP4K2AP48426 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PIP4K2AP48426 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIP4K2AP48426 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIP4K2AP48426 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIP4K2AP48426 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIP4K2AP48426 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIP4K2AP48426 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIP4K2AP48426 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIP4K2AP48426 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIP4K2AP48426 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIP4K2AP48426 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PIP4K2AP48426 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIP4K2AP48426 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIP4K2AP48426 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PIP4K2AP48426 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIP4K2AP48426 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIP4K2AP48426 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIP4K2AP48426 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIP4K2AP48426 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms