Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UTRNP46939 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UTRNP46939 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UTRNP46939 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
UTRNP46939 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UTRNP46939 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UTRNP46939 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UTRNP46939 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UTRNP46939 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UTRNP46939 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
UTRNP46939 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UTRNP46939 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UTRNP46939 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UTRNP46939 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UTRNP46939 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
UTRNP46939 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UTRNP46939 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UTRNP46939 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
UTRNP46939 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UTRNP46939 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UTRNP46939 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UTRNP46939 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UTRNP46939 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UTRNP46939 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UTRNP46939 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UTRNP46939 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UTRNP46939 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UTRNP46939 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UTRNP46939 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UTRNP46939 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UTRNP46939 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UTRNP46939 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UTRNP46939 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UTRNP46939 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UTRNP46939 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UTRNP46939 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UTRNP46939 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UTRNP46939 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UTRNP46939 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UTRNP46939 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UTRNP46939 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UTRNP46939 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UTRNP46939 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UTRNP46939 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UTRNP46939 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UTRNP46939 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UTRNP46939 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UTRNP46939 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UTRNP46939 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UTRNP46939 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UTRNP46939 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UTRNP46939 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UTRNP46939 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UTRNP46939 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UTRNP46939 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UTRNP46939 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UTRNP46939 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UTRNP46939 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UTRNP46939 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UTRNP46939 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UTRNP46939 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UTRNP46939 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UTRNP46939 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UTRNP46939 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UTRNP46939 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UTRNP46939 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UTRNP46939 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UTRNP46939 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UTRNP46939 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UTRNP46939 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UTRNP46939 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UTRNP46939 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UTRNP46939 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UTRNP46939 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UTRNP46939 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UTRNP46939 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UTRNP46939 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UTRNP46939 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UTRNP46939 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UTRNP46939 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UTRNP46939 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UTRNP46939 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UTRNP46939 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UTRNP46939 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UTRNP46939 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UTRNP46939 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UTRNP46939 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UTRNP46939 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UTRNP46939 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UTRNP46939 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UTRNP46939 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UTRNP46939 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UTRNP46939 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UTRNP46939 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UTRNP46939 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UTRNP46939 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UTRNP46939 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UTRNP46939 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UTRNP46939 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UTRNP46939 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms