Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT2P45379 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms