Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSG1P42857 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSG1P42857 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSG1P42857 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSG1P42857 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSG1P42857 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSG1P42857 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSG1P42857 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSG1P42857 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NSG1P42857 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSG1P42857 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSG1P42857 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSG1P42857 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSG1P42857 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSG1P42857 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSG1P42857 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSG1P42857 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSG1P42857 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSG1P42857 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSG1P42857 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSG1P42857 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSG1P42857 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSG1P42857 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSG1P42857 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NSG1P42857 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSG1P42857 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSG1P42857 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSG1P42857 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSG1P42857 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSG1P42857 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSG1P42857 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NSG1P42857 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSG1P42857 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSG1P42857 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSG1P42857 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSG1P42857 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSG1P42857 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSG1P42857 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSG1P42857 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSG1P42857 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSG1P42857 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSG1P42857 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSG1P42857 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSG1P42857 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSG1P42857 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSG1P42857 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSG1P42857 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSG1P42857 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSG1P42857 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSG1P42857 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSG1P42857 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSG1P42857 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSG1P42857 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSG1P42857 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSG1P42857 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSG1P42857 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSG1P42857 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSG1P42857 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSG1P42857 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NSG1P42857 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSG1P42857 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NSG1P42857 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSG1P42857 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSG1P42857 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSG1P42857 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSG1P42857 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSG1P42857 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSG1P42857 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSG1P42857 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSG1P42857 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSG1P42857 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSG1P42857 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSG1P42857 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSG1P42857 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NSG1P42857 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSG1P42857 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NSG1P42857 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSG1P42857 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSG1P42857 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSG1P42857 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSG1P42857 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSG1P42857 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSG1P42857 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSG1P42857 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSG1P42857 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSG1P42857 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NSG1P42857 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSG1P42857 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSG1P42857 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSG1P42857 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSG1P42857 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSG1P42857 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSG1P42857 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSG1P42857 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSG1P42857 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSG1P42857 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSG1P42857 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSG1P42857 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSG1P42857 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSG1P42857 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms