Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPOP42166 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPOP42166 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPOP42166 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPOP42166 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPOP42166 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPOP42166 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPOP42166 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPOP42166 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPOP42166 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPOP42166 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPOP42166 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPOP42166 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPOP42166 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPOP42166 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPOP42166 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPOP42166 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPOP42166 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPOP42166 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPOP42166 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPOP42166 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPOP42166 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPOP42166 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPOP42166 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPOP42166 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPOP42166 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPOP42166 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPOP42166 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPOP42166 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPOP42166 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPOP42166 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPOP42166 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPOP42166 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPOP42166 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPOP42166 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPOP42166 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPOP42166 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPOP42166 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPOP42166 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPOP42166 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPOP42166 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMPOP42166 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMPOP42166 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMPOP42166 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMPOP42166 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMPOP42166 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMPOP42166 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMPOP42166 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMPOP42166 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TMPOP42166 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMPOP42166 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMPOP42166 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMPOP42166 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMPOP42166 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMPOP42166 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMPOP42166 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMPOP42166 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMPOP42166 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMPOP42166 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPOP42166 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPOP42166 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPOP42166 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPOP42166 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPOP42166 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPOP42166 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPOP42166 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPOP42166 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPOP42166 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPOP42166 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPOP42166 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPOP42166 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPOP42166 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPOP42166 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPOP42166 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPOP42166 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPOP42166 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPOP42166 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPOP42166 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPOP42166 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPOP42166 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPOP42166 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPOP42166 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPOP42166 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPOP42166 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPOP42166 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPOP42166 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPOP42166 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPOP42166 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPOP42166 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPOP42166 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPOP42166 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPOP42166 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPOP42166 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPOP42166 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPOP42166 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPOP42166 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPOP42166 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPOP42166 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPOP42166 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPOP42166 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms