Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms