Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms