Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms