Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FLT4P35916 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLT4P35916 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLT4P35916 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FLT4P35916 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLT4P35916 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLT4P35916 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLT4P35916 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLT4P35916 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLT4P35916 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FLT4P35916 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLT4P35916 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLT4P35916 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLT4P35916 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FLT4P35916 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLT4P35916 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLT4P35916 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLT4P35916 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLT4P35916 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT4P35916 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT4P35916 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT4P35916 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT4P35916 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT4P35916 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT4P35916 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT4P35916 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT4P35916 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT4P35916 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT4P35916 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT4P35916 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT4P35916 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT4P35916 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT4P35916 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT4P35916 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT4P35916 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT4P35916 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT4P35916 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT4P35916 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT4P35916 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT4P35916 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT4P35916 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT4P35916 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT4P35916 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT4P35916 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT4P35916 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT4P35916 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT4P35916 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT4P35916 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT4P35916 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT4P35916 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT4P35916 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT4P35916 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT4P35916 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT4P35916 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT4P35916 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT4P35916 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT4P35916 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT4P35916 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT4P35916 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLT4P35916 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLT4P35916 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLT4P35916 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLT4P35916 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLT4P35916 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLT4P35916 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLT4P35916 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLT4P35916 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLT4P35916 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLT4P35916 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLT4P35916 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLT4P35916 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLT4P35916 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FLT4P35916 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FLT4P35916 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FLT4P35916 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FLT4P35916 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FLT4P35916 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FLT4P35916 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
FLT4P35916 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FLT4P35916 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FLT4P35916 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLT4P35916 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLT4P35916 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLT4P35916 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLT4P35916 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLT4P35916 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLT4P35916 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FLT4P35916 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FLT4P35916 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FLT4P35916 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FLT4P35916 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FLT4P35916 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FLT4P35916 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FLT4P35916 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FLT4P35916 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FLT4P35916 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FLT4P35916 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FLT4P35916 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FLT4P35916 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FLT4P35916 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms