Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP6P35125 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP6P35125 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP6P35125 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP6P35125 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP6P35125 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP6P35125 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP6P35125 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP6P35125 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP6P35125 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP6P35125 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP6P35125 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP6P35125 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP6P35125 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP6P35125 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP6P35125 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP6P35125 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP6P35125 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP6P35125 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP6P35125 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP6P35125 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP6P35125 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP6P35125 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP6P35125 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP6P35125 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6P35125 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6P35125 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6P35125 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6P35125 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6P35125 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6P35125 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6P35125 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6P35125 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6P35125 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6P35125 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6P35125 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6P35125 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6P35125 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6P35125 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6P35125 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6P35125 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6P35125 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6P35125 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6P35125 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6P35125 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6P35125 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6P35125 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP6P35125 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP6P35125 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
USP6P35125 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP6P35125 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
USP6P35125 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP6P35125 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP6P35125 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP6P35125 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP6P35125 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP6P35125 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP6P35125 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP6P35125 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP6P35125 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP6P35125 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP6P35125 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP6P35125 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP6P35125 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP6P35125 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP6P35125 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP6P35125 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP6P35125 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP6P35125 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP6P35125 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP6P35125 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP6P35125 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP6P35125 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP6P35125 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP6P35125 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP6P35125 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP6P35125 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP6P35125 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP6P35125 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP6P35125 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP6P35125 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP6P35125 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP6P35125 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP6P35125 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP6P35125 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP6P35125 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP6P35125 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP6P35125 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP6P35125 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP6P35125 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP6P35125 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP6P35125 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP6P35125 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP6P35125 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP6P35125 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP6P35125 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP6P35125 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP6P35125 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP6P35125 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP6P35125 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms