Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2E1P29083 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms