Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms