Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ATP4AP20648 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP4AP20648 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP4AP20648 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP4AP20648 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP4AP20648 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP4AP20648 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP4AP20648 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP4AP20648 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATP4AP20648 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms