Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SLC9A1P19634 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A1P19634 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms