Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2CP19387 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2CP19387 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms