Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATF3P18847 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATF3P18847 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ATF3P18847 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATF3P18847 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATF3P18847 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATF3P18847 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF3P18847 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF3P18847 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF3P18847 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF3P18847 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF3P18847 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF3P18847 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF3P18847 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF3P18847 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF3P18847 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF3P18847 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF3P18847 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF3P18847 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF3P18847 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF3P18847 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF3P18847 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF3P18847 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF3P18847 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATF3P18847 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATF3P18847 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATF3P18847 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATF3P18847 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATF3P18847 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATF3P18847 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF3P18847 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF3P18847 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF3P18847 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF3P18847 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF3P18847 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF3P18847 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF3P18847 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF3P18847 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF3P18847 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF3P18847 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF3P18847 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF3P18847 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF3P18847 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF3P18847 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF3P18847 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF3P18847 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF3P18847 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATF3P18847 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF3P18847 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF3P18847 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF3P18847 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF3P18847 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF3P18847 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF3P18847 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF3P18847 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF3P18847 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF3P18847 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF3P18847 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF3P18847 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF3P18847 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF3P18847 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF3P18847 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF3P18847 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF3P18847 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATF3P18847 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF3P18847 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF3P18847 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF3P18847 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF3P18847 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF3P18847 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF3P18847 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF3P18847 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF3P18847 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF3P18847 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF3P18847 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF3P18847 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF3P18847 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF3P18847 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF3P18847 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF3P18847 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF3P18847 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF3P18847 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF3P18847 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF3P18847 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATF3P18847 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF3P18847 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF3P18847 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF3P18847 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF3P18847 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF3P18847 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF3P18847 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF3P18847 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF3P18847 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF3P18847 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF3P18847 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF3P18847 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF3P18847 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF3P18847 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF3P18847 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF3P18847 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms