Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD46P15529 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD46P15529 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD46P15529 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD46P15529 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD46P15529 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD46P15529 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD46P15529 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD46P15529 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CD46P15529 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD46P15529 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD46P15529 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD46P15529 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD46P15529 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD46P15529 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CD46P15529 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CD46P15529 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD46P15529 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD46P15529 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD46P15529 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD46P15529 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD46P15529 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD46P15529 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD46P15529 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD46P15529 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD46P15529 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD46P15529 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CD46P15529 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD46P15529 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD46P15529 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CD46P15529 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD46P15529 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD46P15529 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD46P15529 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD46P15529 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD46P15529 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD46P15529 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CD46P15529 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CD46P15529 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CD46P15529 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD46P15529 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CD46P15529 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD46P15529 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CD46P15529 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CD46P15529 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CD46P15529 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD46P15529 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CD46P15529 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD46P15529 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD46P15529 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD46P15529 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD46P15529 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD46P15529 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD46P15529 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD46P15529 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD46P15529 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD46P15529 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD46P15529 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD46P15529 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD46P15529 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD46P15529 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD46P15529 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD46P15529 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD46P15529 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD46P15529 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD46P15529 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD46P15529 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms