Protein–RNA interactions for Protein: P10145

CXCL8, Interleukin-8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL8P10145 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CXCL8P10145 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL8P10145 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL8P10145 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL8P10145 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL8P10145 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL8P10145 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL8P10145 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms