Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SAA1P0DJI8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms