Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOP08100 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOP08100 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOP08100 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOP08100 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOP08100 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOP08100 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOP08100 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOP08100 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOP08100 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOP08100 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOP08100 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOP08100 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOP08100 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOP08100 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOP08100 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOP08100 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOP08100 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOP08100 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOP08100 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOP08100 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOP08100 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOP08100 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOP08100 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOP08100 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOP08100 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOP08100 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOP08100 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOP08100 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RHOP08100 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RHOP08100 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RHOP08100 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RHOP08100 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RHOP08100 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RHOP08100 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RHOP08100 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RHOP08100 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RHOP08100 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RHOP08100 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RHOP08100 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RHOP08100 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RHOP08100 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RHOP08100 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RHOP08100 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RHOP08100 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RHOP08100 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RHOP08100 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RHOP08100 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RHOP08100 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RHOP08100 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RHOP08100 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RHOP08100 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RHOP08100 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RHOP08100 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RHOP08100 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
RHOP08100 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RHOP08100 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RHOP08100 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RHOP08100 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RHOP08100 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RHOP08100 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RHOP08100 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RHOP08100 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RHOP08100 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RHOP08100 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RHOP08100 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RHOP08100 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RHOP08100 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RHOP08100 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RHOP08100 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RHOP08100 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RHOP08100 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RHOP08100 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RHOP08100 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHOP08100 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHOP08100 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHOP08100 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHOP08100 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHOP08100 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHOP08100 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHOP08100 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHOP08100 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHOP08100 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHOP08100 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHOP08100 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RHOP08100 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RHOP08100 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHOP08100 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHOP08100 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHOP08100 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHOP08100 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHOP08100 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHOP08100 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHOP08100 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHOP08100 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RHOP08100 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHOP08100 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHOP08100 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHOP08100 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHOP08100 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms