Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHBP07195 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHBP07195 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHBP07195 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHBP07195 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHBP07195 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHBP07195 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHBP07195 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHBP07195 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHBP07195 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHBP07195 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHBP07195 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHBP07195 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHBP07195 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHBP07195 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHBP07195 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHBP07195 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHBP07195 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHBP07195 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHBP07195 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDHBP07195 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDHBP07195 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDHBP07195 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDHBP07195 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDHBP07195 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDHBP07195 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDHBP07195 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LDHBP07195 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDHBP07195 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDHBP07195 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDHBP07195 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDHBP07195 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDHBP07195 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LDHBP07195 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDHBP07195 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDHBP07195 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDHBP07195 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHBP07195 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHBP07195 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHBP07195 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHBP07195 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHBP07195 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHBP07195 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHBP07195 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHBP07195 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHBP07195 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHBP07195 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHBP07195 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHBP07195 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHBP07195 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHBP07195 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHBP07195 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHBP07195 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHBP07195 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHBP07195 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHBP07195 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHBP07195 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHBP07195 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHBP07195 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDHBP07195 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDHBP07195 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDHBP07195 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDHBP07195 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDHBP07195 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDHBP07195 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDHBP07195 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDHBP07195 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDHBP07195 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDHBP07195 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDHBP07195 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LDHBP07195 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LDHBP07195 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDHBP07195 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDHBP07195 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDHBP07195 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDHBP07195 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDHBP07195 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDHBP07195 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDHBP07195 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDHBP07195 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDHBP07195 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDHBP07195 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDHBP07195 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDHBP07195 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDHBP07195 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDHBP07195 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDHBP07195 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDHBP07195 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDHBP07195 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDHBP07195 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LDHBP07195 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDHBP07195 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDHBP07195 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDHBP07195 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDHBP07195 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDHBP07195 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDHBP07195 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDHBP07195 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDHBP07195 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDHBP07195 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms