Protein–RNA interactions for Protein: P00746

CFD, Complement factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP00746 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFDP00746 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFDP00746 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CFDP00746 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFDP00746 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFDP00746 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFDP00746 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFDP00746 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFDP00746 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFDP00746 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFDP00746 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFDP00746 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFDP00746 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFDP00746 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CFDP00746 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CFDP00746 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFDP00746 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFDP00746 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFDP00746 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFDP00746 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFDP00746 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFDP00746 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFDP00746 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFDP00746 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFDP00746 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms