Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM2O94769 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM2O94769 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM2O94769 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM2O94769 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM2O94769 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM2O94769 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM2O94769 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM2O94769 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM2O94769 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM2O94769 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM2O94769 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM2O94769 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM2O94769 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM2O94769 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM2O94769 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM2O94769 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM2O94769 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM2O94769 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM2O94769 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECM2O94769 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ECM2O94769 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ECM2O94769 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ECM2O94769 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ECM2O94769 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM2O94769 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM2O94769 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM2O94769 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM2O94769 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM2O94769 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM2O94769 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM2O94769 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM2O94769 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM2O94769 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM2O94769 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM2O94769 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM2O94769 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM2O94769 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM2O94769 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM2O94769 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM2O94769 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM2O94769 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM2O94769 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM2O94769 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM2O94769 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM2O94769 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECM2O94769 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM2O94769 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM2O94769 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM2O94769 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM2O94769 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM2O94769 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM2O94769 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM2O94769 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM2O94769 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM2O94769 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM2O94769 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM2O94769 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM2O94769 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM2O94769 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM2O94769 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM2O94769 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM2O94769 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM2O94769 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM2O94769 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM2O94769 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM2O94769 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM2O94769 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM2O94769 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM2O94769 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM2O94769 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM2O94769 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM2O94769 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM2O94769 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM2O94769 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM2O94769 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM2O94769 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM2O94769 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM2O94769 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM2O94769 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM2O94769 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM2O94769 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM2O94769 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM2O94769 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM2O94769 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM2O94769 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM2O94769 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM2O94769 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM2O94769 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM2O94769 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM2O94769 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM2O94769 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM2O94769 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM2O94769 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM2O94769 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM2O94769 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM2O94769 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM2O94769 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM2O94769 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM2O94769 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms