Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F6O75461 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F6O75461 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F6O75461 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F6O75461 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F6O75461 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F6O75461 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F6O75461 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F6O75461 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F6O75461 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F6O75461 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F6O75461 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F6O75461 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F6O75461 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F6O75461 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F6O75461 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F6O75461 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F6O75461 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F6O75461 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F6O75461 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F6O75461 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F6O75461 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F6O75461 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F6O75461 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F6O75461 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F6O75461 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F6O75461 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F6O75461 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F6O75461 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F6O75461 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F6O75461 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
E2F6O75461 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F6O75461 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F6O75461 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms