Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms