Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTIFO43310 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTIFO43310 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTIFO43310 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTIFO43310 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTIFO43310 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTIFO43310 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTIFO43310 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTIFO43310 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTIFO43310 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTIFO43310 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTIFO43310 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTIFO43310 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTIFO43310 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTIFO43310 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTIFO43310 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTIFO43310 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTIFO43310 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTIFO43310 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTIFO43310 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTIFO43310 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTIFO43310 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTIFO43310 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTIFO43310 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTIFO43310 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTIFO43310 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTIFO43310 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTIFO43310 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTIFO43310 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTIFO43310 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTIFO43310 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTIFO43310 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTIFO43310 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTIFO43310 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTIFO43310 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTIFO43310 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTIFO43310 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTIFO43310 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTIFO43310 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTIFO43310 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTIFO43310 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTIFO43310 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTIFO43310 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTIFO43310 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTIFO43310 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CTIFO43310 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CTIFO43310 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTIFO43310 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTIFO43310 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTIFO43310 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTIFO43310 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTIFO43310 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTIFO43310 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTIFO43310 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTIFO43310 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTIFO43310 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTIFO43310 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTIFO43310 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTIFO43310 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTIFO43310 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTIFO43310 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTIFO43310 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTIFO43310 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTIFO43310 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTIFO43310 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTIFO43310 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTIFO43310 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTIFO43310 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTIFO43310 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTIFO43310 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTIFO43310 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTIFO43310 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTIFO43310 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTIFO43310 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTIFO43310 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTIFO43310 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTIFO43310 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTIFO43310 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTIFO43310 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTIFO43310 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTIFO43310 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTIFO43310 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTIFO43310 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTIFO43310 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTIFO43310 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTIFO43310 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTIFO43310 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTIFO43310 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CTIFO43310 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTIFO43310 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTIFO43310 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTIFO43310 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTIFO43310 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTIFO43310 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTIFO43310 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTIFO43310 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTIFO43310 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTIFO43310 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTIFO43310 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTIFO43310 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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