Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARPC5O15511 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC5O15511 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC5O15511 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC5O15511 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC5O15511 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC5O15511 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC5O15511 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC5O15511 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC5O15511 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC5O15511 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC5O15511 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC5O15511 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC5O15511 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARPC5O15511 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC5O15511 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC5O15511 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC5O15511 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC5O15511 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC5O15511 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC5O15511 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC5O15511 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC5O15511 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC5O15511 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC5O15511 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC5O15511 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC5O15511 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC5O15511 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARPC5O15511 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms