Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF6O14896 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF6O14896 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF6O14896 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF6O14896 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF6O14896 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF6O14896 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF6O14896 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF6O14896 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF6O14896 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF6O14896 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF6O14896 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF6O14896 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF6O14896 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF6O14896 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF6O14896 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF6O14896 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF6O14896 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF6O14896 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF6O14896 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF6O14896 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF6O14896 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF6O14896 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF6O14896 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF6O14896 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF6O14896 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF6O14896 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF6O14896 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF6O14896 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF6O14896 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF6O14896 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF6O14896 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF6O14896 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF6O14896 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF6O14896 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF6O14896 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF6O14896 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF6O14896 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF6O14896 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF6O14896 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF6O14896 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF6O14896 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF6O14896 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF6O14896 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF6O14896 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF6O14896 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF6O14896 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF6O14896 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF6O14896 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF6O14896 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF6O14896 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF6O14896 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF6O14896 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF6O14896 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF6O14896 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF6O14896 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF6O14896 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IRF6O14896 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IRF6O14896 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IRF6O14896 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IRF6O14896 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IRF6O14896 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IRF6O14896 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF6O14896 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF6O14896 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF6O14896 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF6O14896 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF6O14896 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF6O14896 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms