Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIP1O00291 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIP1O00291 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIP1O00291 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIP1O00291 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIP1O00291 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIP1O00291 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIP1O00291 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIP1O00291 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HIP1O00291 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIP1O00291 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIP1O00291 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIP1O00291 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIP1O00291 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIP1O00291 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIP1O00291 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIP1O00291 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIP1O00291 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIP1O00291 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIP1O00291 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIP1O00291 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIP1O00291 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIP1O00291 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIP1O00291 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HIP1O00291 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIP1O00291 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIP1O00291 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIP1O00291 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIP1O00291 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIP1O00291 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIP1O00291 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIP1O00291 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIP1O00291 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIP1O00291 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIP1O00291 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIP1O00291 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIP1O00291 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIP1O00291 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIP1O00291 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIP1O00291 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIP1O00291 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIP1O00291 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIP1O00291 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIP1O00291 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HIP1O00291 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIP1O00291 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIP1O00291 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIP1O00291 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIP1O00291 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIP1O00291 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIP1O00291 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIP1O00291 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIP1O00291 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIP1O00291 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HIP1O00291 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIP1O00291 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HIP1O00291 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIP1O00291 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIP1O00291 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIP1O00291 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIP1O00291 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIP1O00291 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIP1O00291 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIP1O00291 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIP1O00291 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIP1O00291 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIP1O00291 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIP1O00291 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIP1O00291 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HIP1O00291 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIP1O00291 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIP1O00291 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIP1O00291 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIP1O00291 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIP1O00291 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIP1O00291 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIP1O00291 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIP1O00291 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIP1O00291 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIP1O00291 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIP1O00291 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIP1O00291 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIP1O00291 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIP1O00291 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIP1O00291 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIP1O00291 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIP1O00291 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIP1O00291 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIP1O00291 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIP1O00291 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIP1O00291 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HIP1O00291 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIP1O00291 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIP1O00291 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIP1O00291 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIP1O00291 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIP1O00291 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIP1O00291 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIP1O00291 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIP1O00291 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms