Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HHLA1C9JL84 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HHLA1C9JL84 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HHLA1C9JL84 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HHLA1C9JL84 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HHLA1C9JL84 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HHLA1C9JL84 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms