Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-1B6SEH8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms