Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPDC1A2A3K4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPDC1A2A3K4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms