Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
MAP3K4Q9Y6R4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms