Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCOA3Q9Y6Q9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCOA3Q9Y6Q9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCOA3Q9Y6Q9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCOA3Q9Y6Q9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCOA3Q9Y6Q9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCOA3Q9Y6Q9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms