Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms