Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SAMD4AQ9UPU9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD4AQ9UPU9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms