Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FZD1Q9UP38 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms