Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
L1RE1Q9UN81 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
L1RE1Q9UN81 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms