Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CHIC2Q9UKJ5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms