Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLCO3A1Q9UIG8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLCO3A1Q9UIG8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms